Народився в Москві в родині вчителів. По народженню отримав ім'я Максим (на честь Максима Горького). Батько Гавриїл Якович Кротов, мати Муся Лазарівна Кротова, народжена Ґіндіна; вчителі. Брати: Віктор (1946) і Леонід (1951).
Через півроку після народження Якова його батько був заарештований НКВС та засуджений - спочатку на 15 років, а потім ще на 3 роки таборів. Термін відсидів повністю, після падіння комунізму був реабілітований.
У 1973-1978 роках працював бібліотекарем, потім друкарем у Державній публічній історичній бібліотеці СРСР. Був звідти звільнений за копіювання «антирадянщини» — віршів Осипа Мандельштама.
У 1978-1985 роках працював у Центральному державному архіві стародавніх актів, але був звільнений з ініціативи КДБ - як «неблагонадійний». Потім працював в Звенигородському історико-архітектурному музеї.
В 1983 році закінчив історичний факультет МДУ, дипломна робота присвячена історії російського провінційного дворянства 1556-1622 рр.
Навесні 1990 року залишив державну службу і заробляв на життя перекладами іноземної літератури, а також журналістикою у багатьох російських часописах. Володіє англійською, французькою, польською, німецькою та латинською мовами.
- З 1997 року веде радіопрограму «З християнської точки зору» на «Радіо Свобода».
- Веде блог в Живому Журналі
Яків Кротов був хрещений в 1974 році священиком Олександром Менєм і був його прихожанином до загибелі отця Олександра у 1990 році. При хрещенні прибрав ім'я Яків (іменини у день апостола Якова, брата апостола Івана Богослова).
3 листопада 2002 г. єпископ Апостольської Православної Церкви Віталий (Кужеватов) рукопоклав Я.Кротова у диякона, а 10 листопада 2002 року — священика. В січні 2007 року Яків Кротов вийшов з кліру Апостольської православної церкви. З 14 березня 2007 року указом архієпископа Ігоря (Ісіченко) був прийнятий у число священиків Харківсько-Полтавської єпархії Української автокефальної православної церкви. Яків Кротов є настоятелем парафії Зіслання Святого Духа на апостолів м. Москва.
Детальніше можна подивитись за посиланням -