Кодирование азотистых оснований в цепи ДНК.

Дезоксирибонуклеиновая кислота
это не только макромолекула, но
и структура – линейная
молекулярная решетка. Какие
свойства решетки влияют на
стабильность хранения
информации и ее передачу?
Ответ простой: внутренняя метрика.
С химической точки зрения ДНК — это длинная полимерная молекула,
состоящая из повторяющихся блоков — нуклеотидов. Каждый нуклеотид
состоит из азотистого основания, сахара (дезоксирибозы) и фосфатной группы.
Связи между нуклеотидами в цепи образуются за счт дезоксирибозы и
фосфатной группы (фосфодиэфирные связи). Последовательность
нуклеотидов позволяет «кодировать» информацию о различных типах РНК.
Простое буквенное перечисление последовательности гетероциклов в
спирали ДНК мало информативно и выглядит убого. Дезоксирибонуклеи новая
кислота — это не только макромолекула, но и структура – линейная
молекулярная решетка.
Форма поверхности состоящая из 5-угольных и 6-угольных граней
позволяет разместить на ней молекулы гетероциклов (азотистых оснований).
Однако водородные связи так же, как и принцип комплементарности не
очень согласуются с F или S взаимодействиями BSP. В этом исследовании
на первое место ставится структура нуклеотида, а затем физика
взаимодействия гетероциклов. Структура нуклеотида на основе BSP
вынуждает отказаться от общепринятого принципа комплементарности
и допустить иную спарку гетероциклов: A=G и CT, и отличные от
водородных связи.
   Сделанное допущение позволяет построить структуру нуклеотида из S
семейства многогранников от Буртыка М.В. Burtyka nucleotides это, в первую
очередь, сложный объект, состоящий из нескольких многогранников. На этой
структуре размещаются молекулы блока нуклеотидов. Такой многогранник
можно называть: Буртыка-нуклеотид многогранник.
   ДНК есть последовательность нуклеотидов, образующая спираль. Чем
последовательность (цепь) из polyhedron-nucleotid by Burtyka будет отличаться
от двойной спирали ДНК?

File:Burtyka portraits of amino acid on DNA.png


Семейство многогранников Буртыка М.В.

 The Burtyka family of polyhedra: множество многогранников у которых некоторые грани содержат угол в 109.47 градуса – это части BEP, BSP или производные их взаимодействия.

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/6/6b/The_Burtyka_family_of_polyhedra.png

BEP - Burtyka eighteen polyhedron

E-dodecahedron+EPP

BSP - Burtyka sixteen polyhedron

S-dodecahedron+SPP

14F – Burtyka fourteen-faceted polyhedron

20F - Burtyka twenty-faceted polyhedron

SPP, EPP - polyhedra of poles


https://commons.wikimedia.org/wiki/File:The_Burtyka_family_of_polyhedra.png


Двадцати гранный многогранник от Буртыка М.В.

Burtyka twenty-faceted polyhedron – это дважды усеченный по углам правильный октаэдр. Он образуется при взаимодействии 8-ми BSP по {5}-граням.



https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Burtyka_twenty-faceted_polyhedron.png

Додекаэдр типа S от Буртыка М.В.

S-dodecahedron. Додекаэдр типа S от Буртыка М.В. - это один из 4-х секторов Burtyka sixteen polyhedron (BSP) с усеченными полюсами, состоящий из 12 граней (это 6 пятиугольников и 6 треугольников), 24 ребера и 14 вершин. Основная характеристика такого S-додекаэдра - равенство вершинных углов 5-и угольников 109.47 градуса. Поверхность такого многогранника характеризуется метрикой натурального 4-е базиса.


https://commons.wikimedia.org/wiki/File%3AS-dodecahedron.png


Додекаэдр типа Е от Буртыка М.В.

E-dodecahedron. Додекаэдр типа E от Буртыка М.В. - это один из 4-х секторов Burtyka eighteen polyhedron с усеченными полюсами, состоящий из 12 граней (это 6 пятиугольников и 6 треугольников), 24 ребера и 14 вершин. Основная характеристика такого Е-додекаэдра - равенство вершинных углов 5-и угольников 109.47 градуса. Поверхность такого многогранника характеризуется метрикой натурального 4-е базиса. 

https://commons.wikimedia.org/wiki/File%3AE-dodecahedron.png


Метрическая кодировка аминокислот.

     Размещение аминокислот (Ак) на поверхности Burtyka eighteen polyhedron связывает их с метрикой этой поверхности. Какие необходимы закономерности и зависимости, чтобы правильно написать код Ак и по нему определять структуру радикала и его химический состав?




https://commons.wikimedia.org/wiki/File%3AMetric_encoding_amino_acids_by_Burtyka_M.V.png









Eighteen polyhedron by Burtyka Michael.



В центре восемнадцатигранника (Burtyka eighteen polyhedron) расположены начала 3-х базисов. Единичные вектора (u, x, y, z, v) базиса направлены в центры шестиугольников S {6}.  Единичные вектора (C, T, A, G) базиса направлены в вершины многогранника. Единичные вектора декартового (i, j, k) базиса направлены в центры квадратов k {4}. Eighteen polyhedron он же Burtyka eighteen polyhedron, 18 polyhedron, 18 гранник, восемнадцатигранник.




https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Burtyka_eighteen_polyhedron_-_truncated_rhombic_dodecahedron_by_Burtyka_M.V.png

Восемнадцатигранник от Буртыка М.В. - полуправильный многогранник, состоящий из 18 граней (12  полуправильных шестиугольников и 6 квадратов). Это специфический  усеченный ромбододекаэдр:  Burtyka  eighteen polyhedron (BEP).

Burtyka eighteen polyhedron or bio-polyhedron.







В основе органической материальной формы лежит атом углерода. Именно его метрика порождает метрику молекулярного пространства: внутри и внеклеточное пространство. Это пространство характеризуется 4-е базисом и натуральной алгеброй. Метрические величины в 4-е базисе являются основой биометрии. Последние представления связываются с евклидовым пространством посредством матричных преобразований.



File:Burtyka eighteen polyhedron or bio-polyhedron.png